Durch die Aplerbecker Mark zieht sich das Naherholungsgebiet Nathebachtal. Der Nathebach, der seine Quellen im Südwesten des Stadtteils hat und zusätzlich durch Regenwassereinleitungen gespeist wird, durchfließt diesen in nordöstlicher Richtung und mündet im Stadtteil Aplerbeck in die Emscher. Nach einer starken Überschwemmung Aplerbecks Mitte der 80er Jahre wurde das Nathebachtal aufwendig renaturiert, nachdem in den 70er Jahren des letzten Jahrhunderts der Nathebach in Betonkammersteinen kanalisiert und begradigt wurde.